Nejdůležitějším samosprávným orgánem obce Nivnice je zastupitelstvo obce.
Poradními orgány zastupitelstva jsou výbory. Obec Nivnice zřizuje Finanční výbor a Kontrolní výbor.
Dále je zde zřizována rada obce, jež zřizuje Stavební komisi a Kulturní komisi.